苗种的筛选 罗非鱼苗种运输前1个月应对苗种进行严格的筛选，规格相同的放在同一池内暂养。采用人工手选法，尽量防止苗种鳞片的脱落。入池后的苗种池内水温保持在22℃左右，并全池泼洒消毒剂，防止病菌感染，强化培育20天至30天，保证运输的苗种体质健壮、游动活泼、无病无伤。
苗种的锻炼苗种运输前2天至3天，换掉苗种池内较肥的池水，重新注入干净无污染的河水或井水。冲水时，罗非鱼苗种会争先“抢水”，都涌向进水口，鱼体因为剧烈活动会排掉体内的一些粪便。同时停喂2天至3天，并每天进行1次拉网锻炼。用柔软、光滑的网具将池内的苗种尽可能多地网起来，此时网内的鱼苗密度增大，苗种受到挤压刺激，会分泌大量粘液，排出体内粪便，又逐步适应了密集的环境。
运输工具的准备 运输一般采用汽车，使用纯氧充气运输。装苗的工具为塑料桶或帆布兜，帆布兜内安装无色透明的筒状塑料薄膜，一头扎紧，制成充氧袋。配齐氧气瓶、氧气表、充氧管。充氧头用直径0.6厘米的钢筋焊成80厘米的圆形框架，用0.5厘米的塑料软管绕圆形框架绑牢，塑料管的末端用火烧死防止漏气，然后用注射针头在圆形的软管上均匀扎60个至80个针眼，制成充氧头。充氧头安放在塑料桶或充氧袋内，往里充入干净的河水或井水40厘米左右，打开氧气瓶开关、检查充氧设施，保证每个桶内充氧均匀，气泡大小一致，一瓶氧气负责往4个至6个桶（充氧袋）内供氧，无特殊情况每百公里需备1瓶氧气，为防运输途中意外情况出现，应多备1瓶至2瓶氧气。
鱼苗的运输 当外界的水温稳定在18℃以上时即可起运，运输用水温度控制在20℃，苗种计数装鱼，装鱼时动作要轻，用时要尽量短，每个塑料桶或充氧袋内装鱼的数量应根据路程、苗种规格等适当调控，以70千克至100千克为准。鱼苗装车后，重新检查充氧量，鱼苗在整个运输中，自始至终都有氧气充入，氧气量能小则小，以鱼苗不浮头为标准。运输途中每隔1小时停车检查鱼的活动，检查氧气瓶内贮氧量，及时更换新的氧气瓶。汽车遇到路况不好及大转弯时应减速慢行，避免过分颠簸使鱼体受伤。鱼种运到目的地后，不宜立即开袋放鱼，检查池塘的水温与运输用水的水温，把温差调整到2℃以内。然后用3％食盐水浸洗5分钟至10分钟。运输时选择阴天或傍晚温度较低时进行。
