在用药方面，乌龟有些地方和人一样，有些和人又不一样，部分不能用在人身上的药物（如四环素类），并不禁止用在爬行动物身上，但如果你想让它足够长命或足够健康，在施药上还是尽量避免副作用大的药物。
一、器物消毒
含氯的消毒液（严禁）。含氯消毒液最大的好处就是杀菌效果明显。然而杀菌的同时，含氯消毒液会残留在空气中不挥发，而且污染水源，更可怕的是它的三致效应：致癌、致畸、致基因突变，对人体也会造成相当大的危害，对龟就不用说了。
84消毒液、过氧乙酸（禁用）。８４消毒液主要是用在医院和公共场所的地面、墙壁、门窗等处，腐蚀性相当大，不适合家用消毒，当然就更不适合作为龟舍的消毒。
来苏水、滴露、漂白粉（慎用）。这几种比较温和，溶于水可杀灭细菌繁殖体和某些亲脂病毒，但不适合入口，有些朋友掌握不好比例，如果残留在器皿上，对乌龟至少没有好处。
高锰酸钾（推荐）。高锰酸钾最适合用于瓜果、蔬菜的消毒，有些也被用来清洗皮肤，如果稀释到一定比例，还可以用来洗胃，因此相对适合用做器物的消毒，但使用时还是尽量要掌握好比例。
二、体表消毒（冲洗或浸泡）
双氧水（慎用）。双氧水作为一种强氧化剂，对人体健康是有害的，当然，这跟浓度和量有关。一般来讲，摄入3％以上浓度的双氧水会损害人体健康，摄入较高浓度（大于10％，特别是30％—40％或更高浓度）具有产生严重刺激的危险。虽然我们每天都难免从食物中摄入双氧水，但这毕竟是对人体有害的东西，还是要尽量避免。欧洲一些科学家的试验表明双氧水可能会引起动物的肿瘤，因此在使用时应该非常谨慎。
高锰酸钾（慎用）。高锰酸钾虽然可以用于伤口清洗、坐浴、漱口等，也可用于各类水果的消毒，但注意浓度不宜过高，以免灼伤粘膜。正常浓度为０.１％（相当于淡粉红色）。如果是用来浸泡乌龟，更需要注意，因为它对乌龟眼睛的伤害是个未知数。
土霉素、氯霉素（慎用）。土霉素系抗生素中四环素的一种，以往用于治疗肠胃病，但会造成骨骼和牙齿脆弱，鉴于其副作用较大，近年已被取代。
几乎没有医院用土霉素给人进行过体表消毒的例子，因此用土霉素体表消毒的作用颇值得怀疑，只不过土霉素经常被用来给鱼等水族用，因此就被顺理成章的移植到了水龟身上。那是因为鱼在水里，药粉撒进去，可以被鱼吃到肚子里。但假如乌龟根本没有外伤感染，或我们的目的本不在于让乌龟喝进去，那么用土霉素水浸泡乌龟想达到杀菌的作用就显得很没道理，尤其是陆龟。即便是水龟，我也不认为经常让它呆在这种水里有好处，乌龟不是鱼，其骨骼（或与骨骼相同成分的组织）对它的作用就不用多说了吧。
此外，土霉素适用范围很明确，那就是不能用在被食用的动物身上。关于这一点，我倒不担心论坛里会有人想把自己养的乌龟吃掉。氯霉素（内用）的副作用更大，已被列为禁药，不准在食用动物中使用。若不断摄取氯霉素，会抑制骨髓功能，使身体不能制造红血球、白血球和血小板，造成贫血、抵抗力下降，严重者可致死亡。
淡盐水（推荐）。医院一般使用生理盐水清洗未受感染的伤口，这说明生理盐水是可以用于体表消毒的，当然，如果觉得成本太高，可以自制５％淡盐水，这也是一种生活常识。有些朋友喜欢用粗盐，而实际上粗盐的成分对人既有好处也有害处，但对乌龟尚不得而知。
小贴士：空气消毒——熏醋（推荐），可以预防感冒。
三、外伤消毒、抗菌（涂抹）
红药水（慎用）。主要用于粘膜或皮肤消毒，但穿透力不强，只能用于浅表伤口。在硷性环境下或有脓液、分泌液时，作用减弱。切记，红药水和碘酒不能同时用，会形成碘化汞，产生有毒物质。即使单独用，由于红药水是含有重金属汞的有机化合物，也最好不用。
紫药水（慎用）。用于粘膜化脓感染，能与坏死组织结合成保护膜，因为其“把干”的效果很好，因此对饲养在潮湿环境下的半水龟和陆龟比较合适。虽然有实验表明，紫药水可以致癌，但仅用于外伤这段阶段应该还不至于。
紫药水对深部感染不适用。它的收敛作用对于新鲜、表浅的皮肤外伤具有杀菌和促进伤口愈合的作用，但对已经化脓的伤口表面与坏死组织之间易形成一层保护膜，乍看起来伤口似乎干燥了，实际上会掩盖病情，使痂皮下方的脓液流不出来，加重感染。
碘类（推荐）。以前的碘酒浓度比较高，所以用完了以后要用酒精脱碘，现在的碘类药品浓度都下来了，对皮肤的伤害没有那么大，名字也五花八门，诸如碘伏、安尔碘之类，不需要再用酒精脱碘。同时相比之下，用碘消毒比酒精更胜一筹，因此推荐用碘类。
金霉素、红霉素（推荐）。红霉素膏具有较强的抗菌消炎作用，适用的病种较广，金霉素与其类似，在适用上稍有不同，一般用碘酒消毒后可使用金霉素和红霉素药膏进行涂抹。由于红霉素难溶于水，用于水龟的外伤相对比较适宜。
但如果是较深的开放性伤口，作用就不如云南白药了。但云南白药耐水性较差，需要对乌龟进行干养，这里就不再将云南白药单独列出了。
本篇所说的金霉素和红霉素是药膏，不是药剂或药片，如果作为内用药，这两种都是弊大于利的，就象之前提到的氯霉素一样。至于云南白药，其性热，而乌龟性阴，如果是内用，很可能会相克，关于这个问题等涉及内服用药时再做讨论，在这里就不赘述了。
本篇涉及的都是大家耳熟能详、便宜好找的常用药，具体治疗时还需要因症施药。实际上有用的药并不只这些，有时还有更好的选择；象雷弗诺尔就是一种比较好的外用消炎药。但大多数朋友家里或生活并不会接触太多药品，只要能达到治疗效果就好了。
