因受到药残问题、鱼粉紧涨、欧苗减产等因素的影响，自2005年度开始福建养鳗业亏损达20多亿元，整个行业处于低潮阶段，直至2007年，福建养鳗业才开始逐渐得到恢复；而在此期间广东养鳗业正逐步走向集团化、规模化、专业化发展，并出现鳗鱼产业化巨头企业。
一、形成两大格局：
1、以广东人、台湾人、江苏人为主的日本鳗鲡养殖。广东鳗业商会及协会为企业利益，紧密沟通、协作，逐步达到共同声音应对国外不断提升的技术壁垒。
2、以福建人为主的欧洲、美洲鳗鲡的养殖。福建人养殖非日本鳗鲡经验丰富，主要以福清人、长乐人为主，但养殖特点是规模小而精细，在当地国检、水产部门、鳗业协会、饲料厂共同监管以及技术培训指导下，用药安全意识显著提高，养出健康合格的鳗鱼已作为企业生存与发展的目标。各地有影响力的鳗鱼养殖场领头人成了他们对外代言人，也逐步形成统一声音，应对国外不断的技术壁垒。
二、形成六种养殖模式：
1、广东土池生态养殖模式：以10～20亩/口为主，一般只加水，少换水，通过菌相、藻相平衡，养殖密度以2000～4000尾/亩为主，广东近6～8万亩土池养殖规模主要分布在台山、中山、顺德，以养殖日本鳗鲡为主，通过江苏、福建育苗，在100P以内开始下池，通过肥水养殖，养殖周期1～2年，可全年养殖，每2～3亩配1台1.5KW增氧机，水位1.2～1.5米，每天开机时间8～10h，广东台山的存塘量及投苗量将影响中国日本鳗鲡的鳗价及苗价，今后广东土池由于受到水源及土地资源限制，将维持现状。
2、福清江镜土池生态养殖模式：一般以3～5亩/口为主，养殖面积有1～2万亩，养殖品种以日本鳗为主，放养密度以2000～3000尾/亩为主，一般不放水，只加水，土池外有10～20米宽，长为2～3公里的内河，土池排出的水进入内河，经过微生态菌处理，循环利用，一般很少用药。养殖特点：水质稳定，虫害少，可以过冬，土质带沙质，风力调节增氧，省电，每2～3亩配1台1.5KW增氧机，水位1.2～1.5米，每天开机时间5h左右，该养殖模式显现发展趋势。
3、地表渗透水养殖模式：长乐现共有100多家精养池养殖场，每家规模在20～30亩的精养池养殖面积，一般以水泥底为主，水源利用8～15米地表渗透水，每个场均打10～20口地表井，该养殖模式特点：可常年养殖，养殖品种以欧洲鳗为主，过冬优势明显，易于渡夏，但由于地表水逐年下降，地表井的深度由原来5～6米挖深至15米以上。近期呈限制控制发展趋势。长乐地区存塘及投苗情况将会影响中国欧洲鳗的鳗价及苗价。
4、山区深井精养养殖模式：由于能源紧张，煤碳价格由原来每吨150～200元涨至目前500～800元，许多养鳗场开始打100米左右深水井，每口井花费2～2.5万元，水量一般300～400吨，该水质可解决白苗培育（使用井水明显虫害少，大大降低三类苗数量），同时也可用于过冬老鳗加温。现在山区许多鳗场开始充分利用育苗池排污水，以达节能目的。通常做法：先将白苗排出污水2～3cm后，再用潜水泵把白苗池水抽至老鳗池，改变以往用药品控制过冬鳗病害，逐渐走向充分利用能源，以解决老鳗安全过冬，减少过冬综合症——皮肤溃烂、肝肾病的发生。现在山区精养池打井养殖白苗及过冬鳗呈现“打井热”。该养殖模式一般以养殖欧洲鳗为主，近期内会呈现发展趋势。
5、山区土池生态养殖模式：由于出现孔雀石绿等药残影响，山区土池发展受到一定程度限制，土池背景污染问题存在，使得许多土池暂时处于休整重新改造状态。山区土池近2～3年内可能部分会转向养殖生态鳖或其它水产养殖品种。该模式养殖品种以日本鳗、欧洲鳗均可，近期会呈现萎缩趋势。
6、山区水库网箱养殖模式：该模式在福建的龙岩、闽东、邵武、顺昌等山区呈现发展趋势，养殖特点：水质稳定，用药少，主要以养殖欧洲鳗的黑仔和偏小鳗为主，养殖过程病害少，易于过冬，但发展前景受到全年降雨等因素影响。
