随着我国肉鸽养殖业的迅速发展，养殖中存在的问题也逐渐显现，后养者如能逐渐正确认识存在的问题，就可以及早采取措施，规避风险，从而利于肉鸽养殖利益最大化的实现，目前我国肉鸽养殖业存在的主要问题有：
1、品种品质、质量退化严重
肉鸽种鸽是生产乳鸽、鸽蛋的主力军，其产量多少直接关系到养殖场利润的多少，肉鸽种鸽的品质、质量直接关系到养殖场的兴衰成败，肉鸽养殖业目前仍存在自发性散养，品种来源混杂，近亲繁育，导致品种退化、生产力下降、乳鸽质量下降等问题，这就要求养鸽户注意种鸽质量，及肉鸽种鸽的更新淘汰，到有资质的大型正规企业选购名优品种。
2、缺乏肉鸽饲养管理的知识经验
现在一些肉鸽饲养者，多是其他行业转业而来，或是其他副业扩展和旧棚改造进行饲养，缺乏饲养肉鸽的知识，多数养殖者可以说是“摸着石头过河”，存在很多的盲目性，鸽舍的环境、饲养管理、饲料、疫病防控等技术相对较差，肉鸽养殖效益较小。想要解决这一系列问题建议养殖户有计划。有目的的进行肉鸽养殖专业技术的系统学习，招收有经验的肉鸽饲养员进场管理，邀请肉鸽养殖专家进场指导等。
3、未能形成产、供、销的全产业链
养殖肉鸽想要获得更大的经济效益，不仅要依托集约化、科学管理的饲养管理和有效疾病防控及一定的规模，还要建立产、供、销一体化的全产业链条，形成拳头产品，开阔市场，因此养殖户应该稳扎稳打，向产、供、销全产业链发展。
