草鱼苗种由于鳞片较松，长途运输的成活率较低。另外，长途运输的草鱼苗种由于体质较差，注射疫苗后成活率也较低。为了改变这种被动局面，有条件的养殖户可自己进行草鱼苗种的培育。在草鱼苗种培育过程中要采取生态培育模式，尽量避免使用一些易形成抗药性的药物。
1.主养模式 这种培育模式同鲤鱼苗种的培育模式相似，不同之处主要体现在以下几个方面：（1）草鱼夏花苗种在投放前要用草鱼夏花浸泡疫苗浸泡。（2）给草鱼投喂饲料要采取“两头精中间粗”的三段式投喂模式。鱼苗下塘后，加强投喂配合饲料，待草鱼苗种体长长到6厘米时停止投喂配合饲料，这是第一个“精喂”阶段。从第一个“精喂”阶段结束开始一直到农历白露，这一阶段为草鱼疾病的高发期，该阶段草鱼的死亡率最高，俗称“白露关”。在这一阶段要严格控制饲料的投喂量，饲料以粗纤维含量较高的饲料为主，必要时可搭配投喂适量的陆生嫩草，以控制草鱼暴食暴长，达到控长防病的目的。从白露结束开始一直持续到冬季停食前，这一阶段草鱼的发病率和死亡率已大大降低，为了提高草鱼的越冬规格和越冬体质，应抓住这一有利时机加强草鱼越冬前的强化培育。（3）加强生态防病措施。可通过内服“克虫王”和池中悬挂楝树枝等生态防病办法来预防草鱼车轮虫病的暴发。平时池水消毒要以生石灰为主，尽量避免使用易产生抗药性的商品渔药。
2.套养模式 这种培育模式是在成鱼养殖池中投放草鱼夏花苗种，利用成鱼池中的浮游生物和饲料碎屑来培育草鱼苗种，不需要再另外投喂饲料。（1）夏花鱼苗投放前后7天内禁用杀虫药，以防鱼苗畸形。（2）不必投喂苗种专用饲料，可在一般饲料中掺一些细米糠、麦麸等成本较低的饲料原料。（3）冬季起捕成鱼时尽量使用密眼网，以防草鱼受到损伤。
