刚孵出的稚甲鱼体重只有4克左右体质嫩弱娇小、抵抗能力差、生长缓慢、死亡率高。从出壳到越冬后的第二年初春如饲养管理不当不但增重慢、体质瘦弱 而且会造成大批死亡。在养殖甲鱼生产过程中稚甲鱼的饲养是人工养殖甲鱼成败最关键的一步。其中越冬是稚甲鱼培育中的一个关键阶段。因为稚甲鱼生长期短，个体小，一般仅5克~10克重，在越冬期体能消耗多，死亡率高。因此，要加强越冬管理。
在秋后停食前，适当投喂脂肪含量较高的饲料，促使甲鱼体内脂肪积累，为冬眠作好物质准备。稚甲鱼一般在11月水温降到16℃时，就开始停食，此时要及时做好越冬准备工作。越冬池可利用水位较深的室外成甲鱼池，若利用室内稚甲鱼培育池越冬更安全。可先将室内池水排干，捉出池中稚甲鱼，然后加入30厘米~40厘米厚的泥沙层，并注水至5厘米~10厘米深。再将稚甲鱼(包括室外培育池和网箱中的稚甲鱼)放入池中，放养密度为每平方米100只~250只。当水温降到12℃以下时，稚甲鱼就往泥中钻。如果水温太低，可逐步加些温水，增强稚甲鱼的活力，使其钻得更深些。待稚甲鱼全部钻入泥中，可将池水放满，并在池顶上加盖竹帘，帘上铺一层20厘米~30厘米厚的稻草保温。到第二年4月，水温上升到16℃时，将池水放浅，留5厘米~10厘米深，让稚甲鱼自行出土。
在越冬期间要避免室内温度过低或过高。过低时，会使池水结冰，造成缺氧，这时要适当加温；过高时，稚甲鱼新陈代谢旺盛，影响冬眠。越冬时室温一般控制在0℃~8℃。
