养殖用水处理的目的就是用各种方法将污水中含有的污染物分离出来，或将其转化为无害物质，从而使水质保持洁净，根据所采取的原理和方法，可分为物理法、化学法和生物法。
(一)物理法1.栅栏通常用在养殖池塘水源进水口，目的是为了防止水中个体的杂鱼。漂浮物和悬浮物进人进水口。否则容易使水泵、管道堵塞或使敌害生物进入养殖水体。栅栏通常是用竹箔、网片组成，也有用金属结构的网格组成。2.筛网筛网材料通常为尼龙筛绢。去除浮游动物和尺寸较大的有机物。3.沉淀沉淀是借助水中悬浮固体本身重力，沉淀于池塘底部，使其与水分离。4.过滤过滤是养殖用水处理中比较经济有效的方法之一，它既可以作为养殖用水的预处理，也可作为养殖用水的最终处理。滤料主要有石英砂、炼渣、砾石等。滤料层的厚度与滤料种类有关，粒径较大的滤料孔隙率大，其滤料层需厚一些。相反，粒径较小的滤料，孔隙率小，则滤料层可薄一些，但通常不少于0.5～0.6m。
(二)化学法养殖用水的化学处理是利用化学作用，以除去水中的污染物。通常加化学药剂、促使污染物混凝、沉淀氧化还原和络合。1.重金属的去除养殖用水中不能含有超量的重金属存在，否则，轻则引起养殖对象畸形，重则危及其生存。如仔虾对汞离子的平均承受限度为18Ng/L，超过此限度则会造成仔虾幼体畸形或死亡。养殖生产上去除水中重金属常采用钠盐、其化学名称为乙二胺乙酸二钠，产品为白色粉末状结晶，易溶于水，一旦与水中其他金属离子如汞、铝、铜等相遇，钠离子位置立刻会被其他重金属离子取代而形成新的稳定的化合物，从而大大降低水体内的重金属离子浓度和对幼虾的毒害作用。2.氧化还原法水中的无机物和溶解有机物可通过氧化还原反应
(三)生物处理法1.微生物净化剂法利用某些微生物将水体或底质沉淀物中的有机物、氨氮、亚硝态氮分解吸收，转化为有益或无害物质，而达到水质(底质)环境改良、净化的目的。这种微生物剂具有安全、可靠和高效率的特点。目前这一类微生物种类很多，通称为有益微生物菌群;简称EM菌，产品有海可发、东江菌、蜡状芽孢杆菌、消化菌等。在使用这些有益菌时应注意严禁与抗生素或消毒剂同时使用，使用后3d内不换水或减少用水量。2.水生植物净化法水体中氮、磷转化可在池塘中种植一些水生植物，通过植物光合作用从淤泥和水体中消化吸收大量无机养料(如亚硝酸盐、硝酸盐、氨、磷酸盐等)，从而改善水体理化条件和生物组成，调节水体平衡，净化水质。在池塘中种植的沉水微管束植物有苦草、轮叶黑藻、菹草、金鱼藻等，在河沟、池塘中可种植蕨菜、菱、莲藕、茭白、慈菇、蕹菜等水生蔬菜。也可在水面放养一些浮水植物，如浮萍、水葫芦等
