选配就是对麝的交配进行人工干预，为了实现一定的育种目标，有意识地组织优良的种用公母寮进行配种．选配不仅可以保持和巩固需要的优良性状，而且通过基因的分离和重组，可以产生优良的或新的性状。因此，选配是育种工作中的重要环节之一。选配实际上是一种交配制度。选配按照育种工作的要求不同，分为个体选配和种群选配两大类。个体选配包括品质选择（同质选择、异质选择）和亲缘选择（近交和远交），种群选配包括纯种繁育和杂交繁育。
1 ．同质选配 同质选配就是选用同种麝的产香量、繁殖性能等特点相近，性能表现一致，或育种值相近的优秀个体配种，以期获得产香更高、高繁殖率的优秀后代。选择的双方愈相似，愈有可能将共同的优点遗传给后代。同质选配的作用，主要是使亲本的优良性状稳定地遗传给后代，使优良的性状得以保持与巩固。同质选配不良结果是群体内的变异性相对减少，有时种麝的缺点也有可能得到加强而变得严重，有时适应性和生活力也可能有所下降等。为了防止这些消极影响，要特别加强选择，淘汰体弱或有遗传缺陷的个体。
2 ．异质选配 异质选配，一种是选择有不同优异性状的一公、母麝相配，以期将两个性状结合在一起，从而获得兼有双亲不同优点的后代。例如，产香量高的公麝和产仔量多的母麝相配，使其后代同时具备产香量高、产仔量多两个优良性状。另一种是选同一性状但优劣程度不同的公母麝相配，在后代中以某一麝的优秀性能改良另一麝的不良性能，即所谓以好改坏，以优改劣。
同质选配与异质选配互为条件，不能截然分开，即在某一方面是异质，在其他方面可能是同质，反之亦然。这两种方法经常密切配合，交替使用，以不断提高和巩固整个麝群的品质。
3 ．亲缘选配 根据公、母麝的亲缘关系进行的选配称为亲缘选配。公母麝间的亲缘关系有近有远，有直系有旁系。与配公、母亲缘系数≤1.56 写为远交，亲缘系数≥6.25 %称为近交。
近交的主要作用是固定优良性状，良血统，提高麝群同质性。揭露有害基因，
保持优良血统，提高麝群的同质性。近交常会引起近交衰退。因此，在近交过程中必须严格淘汰所不合要求的、生产力低、繁殖力差、表现出有衰退迹象的近交个体。
4．种群选配 种群选配是根据与配双方隶属于相同或者不同的种群而进行的选配。种群指一个品系、品种、类群或者种类。种群选配分为纯种繁育与杂交繁育。纯种繁育是指在本种群范围内，通过选种选配、类群繁育、改善培育条件等措施，以提高中群性能的一种办法。其基本任务是，保持和发展一个中群的优良特性，增加种群内优良个体的比重，克服该种群的某些缺点，达到保持种群纯度和提高整个种群质量的目的。纯种繁殖有两个作用：一是巩固遗传性，使种群固有的优良品质得以长期保持，并迅速增加同类型优良个体的数量；二是提高现有品质，使种群水平不断稳步上升。
杂交繁育简称杂交，是选择不同种群的个体进行配种。不同品种间的交配常叫做杂交，不用品系间的交配叫做系间杂交，不同种或者不用属间的交配叫做远缘杂交。
