一、确定育种目标
应根据每个奶牛农场主的实际情况认真考虑育种目标。选种的最终目标是获得更理想的母牛，这些母牛能为主人创造更高的经济效益，能够获得高效益的母牛特征如下：①每一泌乳期奶产量很高；②寿命长（泌乳周期多）；③所产的奶可能有高的市场价值。
1、生产性状与牛奶价格
总的来讲，高产奶牛具有高的经济效益，因为这些牛每单位产奶所需的饲料量比低产牛少。
牛奶市场价格是制定育种目标的重要因素，上述的头两个特征是属于生物方面的，对全世界的任何奶牛都适用，但是，牛奶市场价格使得国家与国家间，甚至一个国家的不同地区间选种目标也非常不同。为获得最佳效益，奶牛农场主应根据所建立的牛奶价格体系选择具有如下特征的母牛：
①不考虑牛奶成份的情况下，奶产量最高；
②奶产量和奶脂量最高；
③不考虑牛奶产量时，奶脂量和奶蛋白量最高；
④最少量的奶中含最高奶脂和奶蛋白。
确定育种策略时，应牢记选种是个长期的过程。因为有几代牛连续效应的关系，选种目标应几年不变，这样才能够获得更多的成果。此外，一个选种目标保持越长，一定时间内获得遗传改进也越大。例如，美国花了近20年（1965-1985）时间选种才使得奶产量的遗传价值提高了1000公斤。按最保守的估计今后20年奶产量的遗传价值有可能提高6000公斤以上。
2、寿命长（一生生产能力）和体型结构
奶牛的寿命长是许多奶牛饲养者所期望的性状。寿命长不是指长寿，寿命长仅对一生中产奶量高的牛才有价值。若只是为了选择寿命长而选择，这种选择是无效益的，因为长寿命性状受多种因素影响而且很多因素是非遗传性的。牛群平均寿命的遗传性约为8%。此外，对公牛的预期遗传能力的估计，需要从以这头公牛为父的所有母牛完成它们在牛群中的寿命后才能获得。这一过程要花7-8年的时间。要是公牛那时仍活着，他的生产性状的遗传性很有可能会被青年公牛所超过。实际上，许多牛群中母牛的寿命主要取决于三个条件。一头母牛只要具有下列特征就能留在牛群中：①无严重的乳房炎；②无严重的繁殖障碍（即具有繁殖能力）；③奶产量使农场主满意。
1）功能类型：乳房、脚和腿
功能类型是近几年新出现的词，它是指与一生表现相关的体型结构。功能类型不同于传统的“理想”体型结构，后者的价值是在分类时为农场主争得高分，展览中获胜和作为种畜出售。
一般来讲，体型特征不是预测寿命的好指标。研究表明用奶牛的生产性状来预测其寿命长短比用任何体型特征要好得多，因此，选择公牛时应首先考虑生产性状，其次才考虑体型特征。实际上，应该通过建立一个指数使得选择寿命长这一特征变为程序化，与此同时这个指数可帮助淘汰那些预期遗传能力低和具有明显的体型或繁殖缺陷的公牛。
在所有体型特征中，乳房结构特别是乳头位置、乳房深度和乳房前附着与长寿命是最相关的，研究还表明乳房深度中等的母牛比乳房浅或乳房深的母牛留在牛群中的时间长，这可能是因为乳房浅的母牛生产能力差，而乳房深的母牛容易得乳房炎或受伤的缘故。
尽管许多生产者把脚和腿的特征置于重要的位置，但研究奶牛一生表现的结果表明脚和腿的特征对牛群平均寿命的影响不大。
2）生产性状相对于功能类型
尽管一般认为功能性状可改进奶牛的寿命，但是奶牛很少因体型结构差而被淘汰。乳房下垂的母牛毫无疑问较易发生乳房损伤，脚和腿有严重毛病的母牛也应被淘汰。然而，只要奶牛保持高的生产力，绝大多数农场主倾向于保留这些母牛。如果是属于不健康，或有代谢及繁殖紊乱的情形，无论母牛的体型结构有多好，商业生产者通常都会把它们淘汰掉。
因此，从经济角度出发应该牢记生产性状通常比体型结构特征重要得多。当选种需要考虑确定哪方面优先时，美国大多数的经济研究指出生产性状比非生产性状重要3-5倍。
3）大型牛相对于小型牛
过去25年里，美国奶牛的体型逐渐增大。与已讨论过的其它所有性状一样，这一变化既有遗传的，也有环境的因素。体型越大的奶牛吃的越多，因此理论上讲生产也多。然而，大型牛与奶产量并非紧密相关，换句话说，选择牛奶产量并不一定非要提高体型尺寸。自1968年开始，研究表明小型牛和大型牛的奶产量遗传改良速度实际上是同等的。然而大型牛为维持基础代谢明显需要摄入更多的干物质。因此，如产奶量相同，小型牛明显地比大型牛效率高。
美国的一个详细研究表明：一般生产者喜欢饲养高大，健壮的家畜只是为了在展览会上出售，这些动物将获得较高的评分并在展览会比赛中排名较前。
3、选种计划中应包括多少性状？
虽然，选择一个性状的遗传改进速度比选择多个性状快。通常较理想的是同时选择多个性状。但也必须指出，同时选择4-5个以上的性状将显著地降低遗传改进速率。
随着选择性状数目的增加，选择强度逐渐减弱。例如，如果选择是基于两个性状以上，每个性状的遗传改进仅相当于选择一个性状时的71%。
4、考虑两个性状间的相关性
此外，当确定选择哪个性状以及决定各性状的相对重要性时应该牢记性状与性状之间存在着相关性。
5、如何实现选种目标
为了达到遗传改进的目标，最有效也是最节省开支的方法是为农场选择可用于人工授精的合适公畜。应根据所选性状的预期遗传能力为基准来选择公畜。只有在需要考虑某一特定公畜的使用强度时才使用可靠性。
可以采用实际的牛奶价格体系来计算选择指数以帮助确定最佳公牛从而达到选种目标。
