影响饲料安全性的众多因素中，危害尤为严重的是使用违禁药物和超量抗生素，这一方面需要更为严格的法规并坚定执行，另一方面开发新型饲料添加剂和提高配方饲料也十分重要。丹麦自1998年禁止35公斤以上猪使用抗生素后，每年至少损失2700万美元。
生态型饲料添加剂无药物残留、无抗药性、不污染环境，生产中主要有功能性寡聚糖、生物活性肽。微生态制剂、中草药制剂、酶制剂、酸化剂以及有机微量元素等。这里主要介绍以下几种：
1．功能性寡糖
寡糖亦称低聚糖，是指2-10个单糖原脱水缩合由糖苷键连接形成具有直链或支链的低度聚合糖类的总称。根据寡糖的生物学功能可将其分为功能性寡糖和普通寡糖两大类。蔗糖、麦芽糖、海藻糖等属于普通寡糖，它们可以消化吸收，产生能量，而功能性寡糖是指具有特殊的生理学功能，特别是不被人和动物吸收并促进双歧杆菌的增殖，有益于肠健康的一类寡糖即双歧因子。动物营养界称之为微生态促进剂（Probioitc），饲料工业则称之为化学益生素。现研究表明，功能性寡聚糖除了可促进肠道有益微生物菌相的形成，还可直接刺激肠道免疫细胞，提高免疫球蛋白A的形成。六十年代开始研究功能性寡糖，当时主要作为植物免疫激活因子，八十年代应用于饲料工业上，具有用量少、无毒害、无残留、稳定性强、配伍性好的特点。目前仅有寡聚糖及其类似物被美国食品药物管理局和日本厚生省批准应用于饲料工业中，相信今后有更多的寡糖应用于该领域。功能性寡糖的生产无论是选用酶法水解，还是酶法合成，其成本均较高，制约了其在饲料工业中的应用。
2．生物活性肽
生物活性肽（biologicallyactivepeptides,BAP）就是对动物具有特殊生理功能或生理作用的肽类，这些作用包括激素样作用（如胰岛素生长因子）、免疫调节作用（如白细胞介素）、抗菌作用（如短秆菌肽）、抗氧化作用（如肌肽）以及具有与矿物质结合的特性（酪蛋白磷酸肽）。近些年来已有多种生物活性肽从微生物、植物及动物体内分离出来。开发利用活性肽在饲料生产上将有广阔的前景。从动物胸腺中取出胸腺肽，胸腺肽可促进淋巴细胞分化、成熟，提高动物的免疫机能作用；有胸腺的pp细胞分泌胰多肽。胰多肽具有动物采食，刺激胃液分泌，增强脂肪分解，提高动物的糖耐受量与胰高血糖素的作用；采用透析法从动物脾脏提取肝脏活性肽，脾脏活性肽具有促进动物生长，提高血浆生长激素、甲状腺激素作用。近年来，对特殊生理阶段的饲料（如乳猪料）和特种饲料（如虾料）的技术要求越来越高，选用经特殊加工的富含生物活性肽的原料将是主要的技术手段。现在配方技术尚未对寡肽的种类和数量作出规定，但是已引起人们的关注。
3．微生态制剂
微生态制剂（Microbialecologicalagents）又叫活菌剂、生菌剂，指用动物体内正常的有益微生物经特殊工艺制成的活菌制剂，它既包括微生物生长促进剂，也包括益生素。研究开发饲用微生物添加剂的理论依据主要包括微生态平衡理论、微生态失调理论、微生态营养理论及微生态防治理论等。在饲用微生物添加剂生产用菌种方面，各国都在筛选寻求自己的菌种源。美国食品药物管理局和美国饲料协会不定期公布“一般认为可直接饲喂是安全的微生物品种”，现已达40多种，实际中主要使用乳酸杆菌（以嗜乳酸杆菌为主）、粪链球菌、芽孢杆菌以及酵母，其中乳酸杆菌型微生态制造应用历史最早，制剂种类也最多，包括乳酸杆菌发酵饲料，乳酸杆菌粉及乳酸杆菌提取物。芽孢杆菌的优势在于能耐受胃内的低pH值。饲用微生态制剂的产品质量除了受所选育菌株质量和配方组成影响外，很大程度上受生产工艺的影响。在畜禽口粮中同时添加抗生素似乎会妨碍微生物添加剂的效果。微生态制剂的使用效果极不稳定，尤其面对我国养殖水平参差不齐和养殖条件千差万别的具体国情。
4．中草药制剂
我国拥有丰富的中草药资源和历史悠久的中草药理论。中草药添加剂是复杂的有机体，本身成分多样，再加合理配伍和适当加工，形成了整体协调统一的独特作用：1.增强免疫的作用，现已证明许多中草药所含的糖类、生物碱、苷类和挥发油等成分，这些成分有增强免疫的作用，而且可以避免西药类免疫预防剂对动物肌体组织有交叉反应等弊端；2.激素样作用，实践证明，中草药本身不是激素，但可以起到激素相似的作用，并有减轻或预防、消除外源激素的毒副作用，许多中草药被确认为有胜似激素的激素样的作用。3.抗生素样作用，有的中草药具有广泛的抗菌谱，有的甚至还有抗病毒、抗真菌、螺旋体等的作用；4.双相调节作用，处于亢奋调节为正常，处于抑制调节为兴奋，直至正常的平衡状态。中草药制剂存在的主要问题有：1.添加量偏大，对中草药添加剂应该在微量上下功夫，改变目前剂量偏大，运输不便等局限；2.作用效果不明显，寻求更佳组合，使用效果会更明显；3.品种单一，产品应系列化，使各种功能和各生理阶段的中草药添加剂一应俱全。
