1．正确诊断
任何药物合理应用的先决条件是正确的诊断，对动物发病过程无足够的认识，药物治疗便是无的放矢，非但无益，反而可能延误诊断，耽误疾病的治疗。
2．用药要有明确的指征
要针对患畜的具体病情，选用药效可靠、安全、方便、价廉易得的药物制剂。反对滥用药物，尤其不能滥用抗菌药物。
3．了解药物对靶动物的药动学知识
根据药物的作用和对动物的药动学特点，制定科学的给药方案。药物治疗的错误包括用药错误，但更多的是剂量的错误。
4．预期药物的疗效和不良反应
根据疾病的病理生理学过程和药物的药理作用特点以及它们之间的相互关系，药物的效应是可以预期的。几乎所有的药物不仅有治疗作用，也存在不良反应，临床用药必须牢记疾病的复杂性和治疗的复杂性，对治疗过程作好详细的用药计划，认真观察将出现的药效和毒副作用，以便随时调整用药方案。
5．避免使用多种药物或固定剂量的联合用药
在确定诊断以后，兽医师的任务就是选择最有效、安全的药物进行治疗，一般情况下不应同时使用多种药物（尤其抗菌药物），因为多种药物治疗极大地增加了药物相互作用的概率，也给患畜增加了危险。除了具有确实的协同作用的联合用药外，要慎重使用固定剂量的联合用药（如某些复方制剂），因为它使兽医师失去了根据动物病情需要去调整药物剂量的机会。
6．正确处理对因治疗与对症治疗的关系
对因治疗与对症治疗的关系前已述及，两者巧妙的结合将能取得更好的疗效。
