饲料的安全问题一方面会影响畜产品品质，另一方面畜禽采食有安全性问题的饲料后会对周围环境产生不利影响，现将危害饲料安全的具体因素进行剖析。
人为加入的化学物质对饲料的污染。为了获得足够的畜产品，人们在饲料中添加一些畜禽快速生长所需的化学物质，这类物质如不按规定使用必将影响饲料的安全性。
（1）非法使用违禁药物。农业部于1998年公布了《关于严禁非法使用兽药的通知》，随后又发布了一些更具体的禁用药品品种的通知。强调严禁在饲料及饲料产品中添加未经农业部批准使用的兽药品种。然而，一些饲料加工或畜禽养殖场受利益驱动仍然非法使用一些违禁药物，如催眠镇静剂，激素或激素类物质，导致该类药物在畜禽产品中残留超标，严重影响人体健康。
（2）不按规定正确使用饲料药物添加剂。1997年我国农业部公布了《允许用做饲料药物添加剂的兽药品种及使用规定》，明确指定了对饲料药物添加剂的适用动物、最低用量、最高用量及停药期、注意事项和配伍禁忌等。但是，一些厂商不严格执行该规定，往往超量添加，或不遵守停药期和某些药物在产蛋期禁用的要求，导致该类药物的残留超标，进而影响人体健康。
（3）过量添加微量元素。高铜或高锌对畜禽的生长有一定的促进作用，但过量使用一方面造成该元素在畜禽肝脏中的大量沉积，进而影响人类健康；另一方面这类元素随粪便排泄到环境中，也会对环境造成一定污染，最终影响在该环境中生长的植物以及人类的健康。
饲料生产过程中化学物质对饲料的污染。饲料在加工、生产、运输、储存过程中，很容易受到环境中某些化学物质的污染。如植物饲料在生长过程中，可富集土壤中重金属元素，并残留一定量的农药；动物性饲料原料在加工过程中可能会受到二恶英等化学物质的污染，这类物质可通过畜禽产品，进入人体，当积蓄到一定浓度时会造成多种人体病变。
微生物对饲料的污染。
（1）饲料霉变。饲料霉变不仅会降低饲料的营养价值，同时霉菌的代谢产物，如黄曲霉素B1、赤霉麦毒素等对人和动物都有很强的致病性。
（2）沙门氏菌、大肠杆菌、朊病毒等致病微生物的污染。这类致病性较强的病原微生物可通过饲料使畜禽致病并严重威胁到人类的健康。如某些反刍动物肉骨粉中朊病毒引起的“疯牛病”就震惊了整个世界。
低利用率的配合饲料对环境的污染。使用营养不均衡、配比不合理、利用率低的饲料不仅降低动物的生产性能，其未被消化的剩余部分随着畜禽粪尿排到周围环境中，使各种不易被分解的物质在土壤中富集，造成环境不同程度的污染，如氮污染、磷污染等，最终影响人类的生存。
