秋季管理日照渐短，开放式蓝孔雀舍要点灯补充光照。母蓝孔雀每天保持14小时，后逐渐增至16小时。做好秋季预防接种与驱虫工作在霜降前后，做好安全越冬的一切准备工作。
秋季是换羽季节，为了加速换羽，饲料中蛋白质水平可降至18%-19%，但要保证含硫氨基酸的供应。经难证明，在饲料中加入1%的生石膏粉，有助于新羽再生。换羽期的种蓝孔雀一般每天饲喂三次。秋季换羽期间可增喂火麻仁等，有利换羽。秋季换羽期间采取强制性换羽措施，可以有效地缩短自然换羽天数。在不限制饲喂的条件下，酌喂氧化锌添加剂，可使孔雀七-十天后加速换羽，夜间可试拔主翼羽、覆尾羽，如能轻易拔除则拔羽，拔不动则不要拔，50%羽毛脱落或拔除时，则应停喂锌添加剂。也可使用肌注2500-5000国际单位睾丸酮和5-10毫克的甲状腺素，被肌注母孔雀变得迟顿和不爱活动个别还出现“企鹅”姿势。经三至四天后症状消失，一般于注射后第二天停产，至五至七天几乎全部脱落落大方并开始迅速长出新羽束。此方法同样要做一些活体试验后应用，另外在饲粮中要增加支票物蛋白质和维生素、矿物质、微量元素的含量促进羽毛生长。
及时淘汰掉病、弱不禁风蓝孔雀，以及繁殖性能下降或超阶级过种用年限的蓝孔雀大部分已停产换羽时，可对蓝孔雀进行彻底消毒、接种疫苗和驱虫。
