首先，需要将病羊隔离，并对羊舍和活动场地进行消毒。对于未发病的羊群，也需要进行隔离，并使用碘制剂进行消毒。对于已经发病的羊群，需要及时进行治疗。
清理创面是治疗羊口疮的步。使用温盐水将结痂泡软，然后清除掉腐烂的表皮组织。在清理创面时，带上手术用的橡胶手套，以防止自身感染病毒。
消毒是治疗羊口疮的重要步骤。使用药棉蘸取碘伏溶液对创面进行消毒。碘伏具有良好的消毒效果且对羊的刺激性较小。每天消毒两三次，直到症状缓解。
药物治疗是治疗羊口疮的关键步骤。可以使用碘甘油或红霉素软膏涂擦创面。如果症状严重，可以配合肌肉注射青霉素，每天1-2次，每次40-80万单位。此外，还可以使用病毒唑（三氯唑核苷注射液）和地塞米松注射液按2:1混合肌注进行治疗。
除了以上治疗方法外，还可以采取其他辅助措施来治疗羊口疮。供给病羊柔软、易消化、适口性好的饲料，确保充足的饮水。同时，用强力消毒灵溶液对羊圈舍、场地、环境进行消毒，每天2次，直至病羊痊愈为止。在溃疡面上撒布磺胺类药物粉剂或用淡盐水冲洗溃疡面后吹撒冰硼散也。
