鸡舍消毒的目的是给鸡群在饲养过程中创造一个良好的干净舒适的环境，清除以往鸡群和外界环境中的病原体(细菌和病毒等)。养鸡生产中鸡舍消毒好坏直接影响到鸡群的健康，必须做好鸡舍的消毒工作。
1、鸡舍内清洗和消毒：分四个步骤进行“一扫二冲三喷四空舍”。
(1)步“一扫”：把鸡舍内的杂物、鸡粪、蜘蛛网、羽毛等地清除掉并清理干净。
(2)第二步“二冲”：用清水泵或高压泵抽清水，把鸡舍上下，左右(及墙面、砖柱、窗户、地板)冲洗干净。
(3)第三步“三喷”：用清水泵抽消毒水把鸡舍上下、左右的喷洒，直到滴水珠为止，一般每100平方米鸡舍至少要喷300斤水。
(4)第四步“四空舍”：鸡舍喷洒消毒药后要空置3—5天，让鸡舍自然晾干后，再换一种消毒药水来喷洒，或用高锰酸钾和福尔马林熏蒸。
注：若发生过法氏囊病的鸡舍可改用5%的福尔马林喷洒(重复第三步)。
鸡舍一般的消毒程序安排如下：
清理干净鸡粪后，用水冲洗干净、晾干后，用2%～3%烧碱泼洒地面及1米高墙体，1—2天后用水冲洗、晾干后再用0.3%消毒水喷洒，1—2天后，用0.1%双季胺碘(或2.8消毒液兑水300斤)喷洒1—2天用20%生石灰水泼洒地面及1米高的墙体，空置3—5天后进苗。
2、育雏室消毒：
在第1条规定的消毒程序完成之后，待鸡舍尚未凉干之前，采用福尔马林(甲醛)高锰酸钾熏蒸：
(1)福尔马林：高锰酸钾为2：1。
(2)每立方米空间：25毫升福尔马林，12.5克高锰酸钾(空间立方计算法：长*宽*高，单位：米)。
(3)每间育雏室2—3个瓷碗，将高锰酸钾放入瓷碗后，立即倒入2倍量的福尔马林。
(4)将育雏室门窗关严、密闭，24之后打开门窗通风换气。
(5)注意事项：
A、盛福尔马林的容器只能用瓷碗和土陶碗，不能用木质或塑料制品。
B、倒入福尔马林时一定要小心头、脸、手要尽量远离瓷碗，防止液体溅出后伤人。
C、倒入福尔马林后人应立即离开育雏室，并且关好门窗。
D、经过熏蒸消毒的育雏室要空置2—3天后才能进小鸡。
3、鸡舍外消毒
先把鸡舍四周杂草、鸡粪铲除。鸡只集中添埋或烧毁后，晴天用2—3%烧碱水或20%生石灰水泼洒。
4、用具消毒
先把用具用清水洗干净后，用消毒水浸泡半以上，晒(凉)干后搬入消毒好的鸡舍。
5、工作间消毒
工作间是储藏饲料、谷壳及杂物的地方，病原体容易在这种地方生存，养完一批鸡后要把杂物搬出来，清扫干净，用消毒药喷洒消毒。
6、接种疫苗用的器械消毒(禁用消毒药水消毒)
注射器、滴眼用的滴瓶、刺种针等，先用清水洗干净后，煮沸30，晾干备用。
7、带鸡消毒
带鸡消毒是指在鸡舍内有鸡的情况下，对鸡舍空气消毒，用低浓度无刺激性或刺激性小的消毒液进行喷雾消毒。
带鸡消毒的好处：可杀死空气中或附于鸡毛上的病原微生物，另外，喷雾消毒还可增加鸡舍空气的湿度，灰尘，暑热天还可降温。 带鸡消毒的操作方法及注意事项：
(1)喷雾带鸡消毒(夏天：中午气温高时应隔1到2天进行1次)
A、喷雾器要清洗干净，用专门的喷雾器。
B、冷天使用温水，可减少鸡群应激。
C、选用刺激性较小的消毒剂。
D、药液浓度要足。
E、带鸡消毒是消毒空气，所以喷头距离鸡的高度至少要一米以上，并且喷头要朝上。
(2)熏蒸带鸡消毒
A、醋酸熏蒸法
每千只鸡准备小铁罐4—6个，醋精若干。
方法：1两醋精对1公斤水，装于易拉罐内，放在煤炉上，均匀地分布在鸡舍内，让醋精水自然挥发
养鸡户为避免陷入消毒误区，致使消毒达不到理想效果，在消毒过程一定要掌握消毒技术要领。
