石灰。消毒力强、价廉易得，是消毒性好、无不良气味、无污染的消毒药物。
将生石灰直接撒在圈舍地面是不正确的，因撒石灰时会导致鸭鹅舍内石灰粉尘大量飞扬，使鸭鹅吸入呼吸道内，人为地造成一次呼吸道炎症，也经常造成鸭鹅爪部灼伤，或因啄食石灰而灼伤口腔及消化道。正确使用石灰消毒的方法是将新鲜的熟石灰加水配制成10-20%的石灰乳，也就是将生石灰与水按1：7混合反应后滤除残渣即得，涂刷鸭鹅舍墙壁和地面1-2次。也可用于粪便和尸体消毒。对大多数病原微生物具有较强的作用。
甲醛。对绝大多数的病原微生物（包括芽孢和真菌）都有强大的作用，而且价格低，没有腐蚀性。常用作熏蒸消毒和喷雾消毒。它的消毒作用与环境温湿度关系很大，温度越高消毒效果越好。在熏蒸消毒时，还应使环境相对湿度达到80-90%，才能使其充分发挥消毒作用。熏蒸消毒时可将福尔马林加3-5倍的水，放入铁锅中加热煮沸（不可加高锰酸钾）。用高锰酸钾作氧化剂熏蒸时，可在甲醛溶液中加入2倍量的水，注意不要直接将高锰酸钾投入甲醛溶液中，以免溅出伤人。
正确的熏蒸方法是：选用陶瓷或搪瓷容器，将高锰酸钾溶于30-40℃的温水中，然后再缓慢加入加水的甲醛溶液，注意容器的容积应大于高锰酸钾溶液和甲醛溶液总容积的3-4倍。使用甲醛对鸭鹅舍进行熏蒸消毒时，动作要快，以免产生的烟雾伤害到人的黏膜。
