1、蛋壳表面的清结度，蛋壳表面不应有粪便、泥土等污物，否则，污物中的病原微生物侵入蛋内，引起种蛋变质。或由于污物堵塞气孔，妨碍蛋的气体交换，影响孵化率。同时在孵化过程中污染机器，如果有少许种蛋受到轻度污染，在入孵前先进行必要的处理后方可入孵。
2、形状大小，蛋形应要求正常，呈卵圆形，过长过圆、两头尖等郡不宜作种蛋使用，蛋重应符合品种要求，放大过小都不好，蛋重过小付出的雏鸭较小，蛋重过大孵化率低。大型肉鸭蛋重一般为85～95克为宜。
3、保证种蛋的新鲜，种蛋的贮存时间愈短愈好，以贮存7天为宜，3～5天为好的保存期。两周以内的种蛋可保持一定的孵化率，若超过两周则孵化期推迟，孵化率降低，雏鸭弱雏较多。种蛋的新鲜程度除与保存时间有关外，还与保存的温度、湿度、方法等有关。
4、蛋壳的结构，致密均匀，表面正常，厚薄适度。蛋壳厚度一般为0.035～0.04毫米。蛋壳过厚，过硬时，孵化时受热缓慢，水分不宜蒸发，气体交换不良，破壳困难;过薄时水分蒸发过快，孵化率降低。蛋壳结构不均匀，表面粗糙等均不宜作种蛋使用。
5、种蛋的来源首先应注意种鸭的品质，选择那些遗传性能稳定、生产性能优良、繁殖力较高、健康状况良好的鸭群的种蛋。
