水草造景缸底部的砂床是非常重要的，不但兼具了所有水草生长的基本需求，更为重要的是提供了硝化细菌生长的场所，这些细菌是会分解有害物质的微生物。此外，底砂更提供重要的养分供水草生长吸收（需要事先添加底肥）。
在水族市场出售的底砂种类有很多种，它们的色泽以及大小各不相同，根据材质的不同，我们可以把它们分为两大类：
1.矽砂：主要成份是二氧化矽（SiO3），在工业中是用于制造玻璃的原材料，并且在制造过程中呈酸性反应，被视为酸性物质。因为二氧化矽在水中呈不溶性，因而在水草造景缸中使用不会影响水质以及使pH值产生变化，所以，这种类型的砂砾最适合于用作水草栽培的底砂。
2.石灰质砂：含有石灰质成份特别高，主要成份是碳酸钙（CaCo3），在工业中可用于制造水泥的原材料，并且在制造过程中呈碱性反应，被视为碱性物质。因为碳酸钙微溶于水以及在含有CO2的水中会有更高的溶解度，水质中的钙盐含量大为提高，因此在水族箱中使用会导致水质的硬度和pH值提高，因此，这类砂砾（如：珊瑚砂和贝壳砂）不适合用作水草栽培的底砂。
根据砂砾的色泽而言，白色或者浅色的砂砾较能反射光线，有助于水草光合作用的同时，也较能引发藻类滋长蔓延；黑色或者深色的砂砾可以衬托水草和鱼类的艳丽色彩；而土色或者黄褐色的砂砾则最能够体现自然景观的风貌。
在选用各自所需的砂砾的同时，要注意砂砾的材质不应该太粗燥，也不能过于细碎，尖锐的岩石片则千万不能采用，否则会使底栖性的鱼类受到伤害。也需要注意砂砾的粒度大小，砂砾的直径不易太大或太小，否则也会影响到水草的生长状况，一般直径约为1.5-4mm大小之间的砂砾最为适合使用，但实际也依据种植水草的种类不同而略有差异。
