乌鳢在人工养殖条件下，由于养殖密度高、人为操作损伤、池塘有害物质的增加、病原体的滋生积贮、饲料鱼的病变等等，导致发病率增加，特别是在种苗阶段的危害更大，常造成较大的经济损失。
1．小瓜虫病
该病病原体为小瓜虫。小瓜虫寄生于乌鳢的鳃、皮肤和鳍条上，初发时，粘液增加，运动失调，严重时鳍条开裂，皮肤上出现白点（俗称白点病），表皮发炎，鳞片脱落。如果寄生在鳃上，造成鳃丝分泌粘液增加，鳃丝肿胀，眼眶充血。病鱼开始漂浮水面，行动缓慢，反应迟钝，然后死亡。此病在鱼种培育阶段最易发生，常造成种苗大量死亡，危害较大。防治方法：（1）鱼种投放前用生石灰彻底清塘，鱼种、饵料等都要消毒。（2）用20×0.000001—40×0.000001的福尔马林全池泼洒。（3）用0.02×0.000001的硝酸亚汞全池泼洒。
2．暴发性出血病
病鱼的鳍基和下颌至肛门的腹部发红，特别是胸鳍基部和靠近鳃盖后缘的体壁有垂直鱼体侧线的出血条纹，有的眼眶和肌肉充血，严重时腹部肿胀。解剖可见肝脏瘀血，肠胃中空充血，具有腹水等。从发现充血到死亡一般只有3—4天时间。此病从鱼种到成鱼阶段都有发生，特别是冬季没有清塘，塘底淤泥积厚，水质肥沃，养殖密度高，投喂饲料过剩的鱼塘更易发生此病。防治方法：（1）冬季捕鱼之后，清除池底淤泥，用150—200kg/亩的生石灰全池泼洒消毒。（2）选用新鲜无病的饵料鱼投喂，饵料投喂前最好用30—50‰的食盐溶液浸泡30—60min消毒。（3）每隔15—20天用25kg/亩的生石灰全池泼洒消毒。（4）用20×0.000001—40×0.000001的福尔马林全池泼洒。
3．水霉病
水霉病病原为水霉菌。病鱼体表出现血点，食欲减退，鱼体消瘦，病灶部位黑色素消退，出现灰白色，色泽暗淡无光，离群独游。最后长出絮状白色丝状体，肌肉呈浊白色直至死亡。此病在乌鳢的各生长阶段都有发生，但在越冬期间更易感染，当水温上升到18℃左右时会大量暴发。防治方法：（1）放养前用100—150kg/亩的生石灰干法清塘。成鱼池定期用生石灰或漂白粉消毒。（2）发病期间，用0.2×0.000001的孔雀石绿溶液浸泡，当鱼有不适感时，便把鱼移走。（3）发病期也可以用20×0.000001—40×0.000001的福尔马林或30×0.000001—50×0.000001的高锰酸钾全池泼洒。（4）苗种捕捞、运输、操作等过程要小心，防止鱼体受伤，并用30—50‰的食盐溶液或用20×0.000001的孔雀石绿溶液浸泡10—20min。
4．鱼鲺病
鱼鲺病病原体为鱼鲺。该病在乌鳢养殖中较为常见，乌鳢被鱼鲺寄生后，极度不安，产生狂游、窜跳，体表粘液增多，同时容易并发生水霉病等，严重时也会引起种苗大量死亡。5—9月水温较高时为发病旺季。防治方法：（1）用90%的晶体敌百虫全池泼洒，浓度为0.5×0.000001。（2）用杀虫剂（用量参照说明书）。
5．碘泡虫病
碘泡虫病病原体为碘泡虫。鱼体被寄生后在水面打转，体色发黑、无光泽，腹部肿胀。解剖时有淡黄色腹水，幼鱼肾脏有少量的碘泡虫的孢囊，呈白色或淡黄色。肾脏坏死导致腹水，直至死亡，该病感染率可达90%。幼鱼和成鱼均有感染。流行于5—8月。治疗该病目前尚无良药，轻度发病可以控制，重者无法治疗，所以一般以预防为主：（1）用生石灰彻底清塘，以杀灭底层淤泥中的孢子，并于清塘后次日用铁耙将底层淤泥翻耙一遍。（2）病、死鱼收集起来，埋于离池塘较远的土中。（3）在5—9月，每隔半月用0.3×0.000001—0.5×0.000001的晶体敌百虫全池泼洒，鱼种中用1×0.000001的晶体敌百虫浸泡3—10min。
6．红线虫病
病原体为藤本嗜子宫线虫。雌体寄生于乌鳢的背鳍、臀鳍和尾鳍的鳍条之间，雄体寄生于鳔和肾内，除上述寄生部位外，一般肉眼看不出其它明显症状。此病多流行于长江流域，感染率可达90%。一般用30—50‰的食盐溶液或1×0.000001的晶体敌百虫（90%）溶液浸泡病鱼。
7．蓝藻引起中毒
由于乌鳢养殖池普遍水质肥沃，特别在高温季节，易产生蓝藻水华，pH值显著升高，藻类大量死亡分解，易产生羟胺和硫化氢等有毒物质。中毒后病鱼一般表面无明显症状，但鳃耙上有蓝藻积贮，鳃呈暗紫色，肝脏有块状淡黄色班纹，胆囊色淡，肠道充血。初期出现狂游，特别是夜间会跳出水面，此后行动缓慢，停滞于池边、水草边。治疗方法：（1）用0.6×0.000001—0.7×0.000001的硫酸铜溶液全池泼洒，施药后开动增氧机，12小时后更换1/3—1/2的新水。严重的池塘换水后，最好再施20×0.000001的高锰酸钾。
