水蛭在放入饲养池之前，要对蛙池进行消毒处理，不要直接投放，不管是水泥池还是泥土池都要消毒。
一、泥土池的消毒
养殖水蛭的蛭池无论是旧池塘或新挖的池塘，都要用生石灰或漂白粉进行消毒。
(一)生石灰消毒法
在池底选几个点，放入生石灰(最好用刚出窑的灰块)，用量为每平方米100 克左右。池塘中放水10 ～ 20 厘米深，待石灰化开后，用水瓢将石灰浆全池泼洒。过一段时间再将石灰浆和水混合均匀。清塘(即把消毒水放出)后l 周左右再注人新水，即可投放水蛭种苗。用生石灰清塘消毒，既可以杀死塘中的寄生虫、病菌等有害生物，还可以使池水保持一定的新鲜度，又能改良土质，并将池底中的氮、磷、钾等营养物质释放出来，增加水的肥度。
(二)漂白粉消毒法
漂白粉清池消毒，每667 平方米(l 亩)池面用5 ～10 千克。如带水消毒，水深0 . 5 ～1 米，使用漂白粉的量要加倍，即每667 平方米池面用10 ～ 20 千克，全池泼撒。漂白粉遇水后释放出次氯酸，次氯酸放出的新生态氧可杀灭病菌等有害生物。其效果与生石灰差不多，但药性消失比生石灰快。一般用漂白粉清池消毒后3～5天，即可投放种水蛭进行饲养。
二、水泥池的脱碱
新建造的水泥池，表面对氧有强烈的吸收作用，可使水中溶氧量降低，pH 值上升(呈碱性)，形成过多的碳酸钙沉淀物。为了给水蛭创造一个良好的生长环境，有必要对新修建的水泥池在使用前进行脱碱处理。脱碱的方法一般有以下几种。
(一)过磷酸钙法
对新建造的水泥池，蓄满水后按每立方米水体1 千克的比例加入过磷酸钙，浸池1 ～ 2 天，放掉旧水换上新水后，即可投放种苗。
(二)酸性磷酸钠法
新建的水泥池，蓄满水后按每立方米溶入20 克酸性磷酸钙，浸泡1～2 天，更换新水后即可投放种苗。
(三)冰醋酸法
新建水泥池，可用10 %的冰醋酸洗刷水泥池表面，然后蓄满水浸泡1 周左右，更换新水后即可投放种苗。
(四)薯类脱碱法
若是建设小面积的水泥池，急需处理又无上述药物时，可用番薯、土豆等薯类擦抹池壁，使淀粉浆粘在池表面，然后注满水浸泡1 天即可脱碱。
经以上脱碱方法处理后的水泥池，可以用pH 值试纸或者从水中的粘度、产生水垢及沉淀物的多少等来了解其脱碱程度。然后将蛭池清洗干净，灌水后先放人几条水蛭试养1 天，确无不良反应时，再投放种苗饲养。
