猪乙型脑炎的诊断主要是根据临床症状及实验室诊断，其次就是注意与猪布氏菌病、猪流感和猪伪狂犬病相区别。
1根据流行病学和临床症状
乙脑的诊断依靠流行病学调查、临床诊断和实验室诊断来完成，由于乙脑临床症状与许多疾病相似，故不能仅根据临床表现进行确诊，必须进行实验室诊断，即使是疫区病例也是如此。实验室诊断包括病原检测和血清学诊断。病原学检测方法包括病毒的分离、鉴定，反向被动血凝试验，免疫细胞化学法和PCR诊断方法等。用于乙脑诊断的血清学方法包括乳胶凝集试验(LAT)，补体结合试验(CF)，血凝抑制试验(HI)，中和试验(SN)，斑点免疫渗滤试验，酶联免疫吸附试验(ELISA)，间接免疫荧光试验(IFA)、间接血凝试验(IHA)、放射免疫测定，免疫电镜技术等。其中华中大学动物医学院病毒室的贾杏林等(2000)建立的LAT方法具有特异、敏感、微量、、稳定、简易的特点，特别适合于基层使用及大规模流行病学调查。
2类症鉴别
注意与猪布氏菌病、猪流感和猪伪狂犬病相区别。
2.1与猪布氏杆菌病的区别
猪布氏菌病的流行无季节性，体温正常．流产多发生于妊娠的第三个月，多为死胎，胎盘布满出血点，极少有木乃伊胎；公猪睾丸多为两侧种胀，副睾丸也肿；有的病例还发生关节炎，特别是后肢淋巴结肿胀。
2.2与猪流感的区别
猪流感妊娠母猪少见流产。
2.3与猪伪狂犬病的区别
猪伪狂犬病无季节性，流产胎儿无差异．且哺乳仔猪发病较多，呈现神经症状，公猪无睾丸肿大现象。
