莲瓣兰与其它的兰花一样，因管理不当会发生各种病虫害。病虫害一旦发生加上防治不及时，对兰花的生长危害相当严重，影响兰叶的观赏价值。莲瓣兰虫害不算太多，但是还要注意防治措施，主要常见的有以下几种：
介壳虫。介壳虫有多种，有黄介、粉介、红介和黑点介等。介壳虫靠有吸盘吸附于兰叶上，吸食叶绿素为生，是一种极为顽固又易发生的害虫。发生介壳虫害之后，即使将它消灭，也给绿色的兰叶留下白点和黄点，严重时一片兰叶特别的是叶根部全变成白黄相间的残痕，加上兰是一次性长成，永远也不能恢复原状。介壳虫滋生的原因一是盆上水份过重，再是养植地点不通风或是通风不够。
红蜘蛛。红蜘蛛是一种软体小动物。它主要是依靠吸食叶绿素生存，莲瓣兰一经被侵袭，整个叶面渐渐地丧失叶绿素，出现小白点，严重地破坏兰株生长。这种害虫繁殖力强，一发生就成群地集结在叶的背面或叶辆部，吸食养份。红蜘蛛产生的原因是盆土过于干燥和通风很差。
蓟马。蓟马也是一种危害兰叶的害虫。它们也是从兰叶表皮组织中吸食养料，使叶面留下终身不能恢复的小白点。这种害虫产生的原因是兰株原来感染，栽培的地方不通风。
莲瓣兰在管理上栽种时消毒不严，浇水掌握不当，放置的地点不通风等等原因，造成病菌没有杀死，水分过重，湿度过大，通风不良等，由此而发生病变。莲瓣兰病变的产生首先表现在兰叶上，就是出现黑斑块或黑点，最后传染开来，致使叶片完全病死，以致全株或全盆死亡。莲瓣兰由于管理不善和施肥过多，也会出现黑斑黑点和烧尖等现象。因此，要将好草与病草分开来栽培，便于采取彻底根治。莲瓣兰的病害有以下几种：
黑斑病。黑斑病又称为褐斑病，这是叶面上出现黑色的斑块和点，且逐步漫延，造成整片兰叶死亡。这种病常常发生在霉雨季节，往往在空气湿度相当重，风少而盆土的水份多的情况下发生。
霉腐病。莲瓣兰霉腐病表现有三种情况：兰花霉腐病、细菌软腐病和病毒病。这几种病毒病危害相当大，传染也快，染上后无法控制，最终全株枯死。这几种病毒病迄今为止，由于产生的病因不明，也没有什么特效的药物可以治疗和预防，只有在产生病害之前加强管理，注意通风和盆土的干湿度。当出现病毒性病害之后，一定要将得病的兰叶或兰株剪去，严重时必须将得病的兰盆隔离，放置于其它地方，避免传染。
