青贮是目前最好的秸秆贮存方法，它可最大限度保持养分。
单纯青贮
只要严格按照规程操作，青贮过程中注意压实、密封，会自然进行微生物发酵，使得青贮料带有轻微的果香味，牲畜比较爱吃，也容易消化。此种方法发酵时间长，一般需要30天左右，不足之处是饲料中有益菌群单一，发酵成功率也较人工发酵法低。同时，因酸度较低，在取料时很容易造成“二次发酵”，即霉菌感染，使外层青贮料发黑、发霉，不能喂牲畜而浪费掉。
酸贮
酸贮，即利用化学方法，在贮料上喷洒某种酸性物质，以抵抗杂菌侵害。该方式简单易行，且能较有效抵御“二次发酵”，取料较为容易。此法较适宜黄贮，即较干的秸秆贮存，它还可使干秸秆适当软化，并增加口感和提高消化率。但它的缺点也是显而易见的，首先它只是“保存”秸秆而非“提高”秸秆营养。其次，成本也偏高，制作每吨饲料约增加酸贮剂投入48元。
人工微生物发酵法
人工微生物发酵法的制作方法和单纯青贮一致。所不同的是，在青贮过程中要接种微生物发酵剂，即将微生物干制剂在温水中活化，均匀喷洒在青贮料中。此种技术除了有单纯青贮所具有的优点外，还具有发酵期短且成功率高、有益菌群丰富、营养价值高、提高消化率，减少粪便臭味、预防牛乳房炎的作用，并可作干秸秆发酵，甚至直接添加到饲料中，在动物体内“发酵”等。
