食用菌细菌病害
细菌属原核生物界，为单细胞生物。菌体形状有杆状、球状和螺旋状，繁殖方式主要是二分裂法，生长速度较快，危害较大。对食用菌危害较为常见的有芽孢杆菌属（Bacillus）、假单胞杆菌属（Pseudomonas）、黄单胞杆菌属（Xanthomonas）和欧文氏杆菌属（Erwinia）中的种类。
危害症状
在食用菌菌种分离、培养中常受细菌污染。若接种点被污染，则会影响菌丝的生长扩展；菇床培养料被侵染，表面出现黏湿、色较深，并散发出酸臭味，严重时培养料变质腐烂，阻碍食用菌菌丝的发育。
形态特征
芽孢杆菌在其细胞中能形成芽孢，菌落表面较干燥，呈皱折状，色黄白至灰色；假单细胞杆菌和黄单胞杆菌均为端生鞭毛，欧文氏杆菌为周生鞭毛。
发生规律
芽孢杆菌在自然界中广泛存在，由于芽孢对高温有很强抗性，在121℃蒸汽灭菌或间隙灭菌条件下才能被杀灭，因此培养材料灭菌不彻底，或操作不规范，都有可能造成细菌污染。培养基和培养料pH呈中性、含水量高有利于细菌生长。
防治方法
制种所需的培养基，器皿必须按要求严格进行灭菌；严格按无菌操作要求进行接种，防止菌种带菌。
病毒病害
危害症状
蘑菇感染病毒后症状随侵染时间、病毒种类、蘑菇品种和环境条件不同而有变化。总的来说，菌丝体生长缓慢，子实体在覆土内层形成针状菇；已长出子实体则表现矮化，早熟易开伞，无菇盖和菇柄区分，或菇盖发育不良、平而小，菇柄有时长得粗而短呈鼓棒状或圆桶状，上有褐色条斑深入组织，有时则细而长。淡褐色病菇往往出现在头潮菇中，而在后几潮菇中很少发生。
发生规律
初侵染来自感病活菌丝和带有病毒的蘑菇孢子。被病毒感染的孢子略小于健康孢子，但萌发快（因孢壁较薄易萌发），并已证明感染病毒的孢子经贮藏9年后仍能传播病毒。病毒侵染菇床主要通过风传播感病毒孢子，昆虫活动、采收人员等接触传播，以及有病包装材料、未经消毒的工具引起病害蔓延和扩散。在菇架、菇盘的木料中残留有病菌丝，可引起下季蘑菇病害发生。覆土前“感病”孢子落在菇床上才能得以侵染，倘若仅溅落在土层表面，一般不发生感病。“感病”孢子萌发后，就与正常的蘑菇菌丝扭结在一起。随着菌丝生长，培养料便被病毒全面污染，从播种到头潮菇出现，菌丝生长最活跃，菌丝融合也较频繁，使健康菌丝感染病毒。在孢子芽管超薄切片中，可以看到许多病毒粒子，这些芽管能与健康菌丝融合而转移病毒。品种反应：双孢蘑菇的许多品种（系）对此病是感病的，而大肥菇的品系则相对抗病。
防治方法
选育抗病品种（系）是理想的防治方法，严格的卫生措施是控制病毒危害的基本条件，必要时可以改种有抗病能力的大肥菇；用报纸或塑料薄膜覆盖于菇床培养料上，防止感病孢子侵染；发菌期间，每星期用0.5%甲醛喷纸或塑料薄膜（用量100平方米纸需30升水加150毫升甲醛），覆土前一天，先喷甲醛，然后再掀膜；防治菇蝇和螨类，可减少病毒感染；及时采菇，菇床上如出现病毒病的征兆，要摘除患病的子实体，并喷晒2%甲醛液消毒，再用纸或塑料薄膜覆盖；化学防治：木制品喷4%五氯酚钠加0.5%-1%苏打混合液，菇房地面用2%漂白粉液消毒，工具或床架用5%甲醛液消毒，手和小工具可在软肥皂水溶液加磷酸三钠中消毒。
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