引发黄鳝疾病的原因是多方面的，故应采取综合性的预防措施，加强日常管理与消毒措施，才能有效地预防病害的发生。任何传染性疾病的发生，必定有病原体的存在。因此，预防疾病应从控制或消灭病原体着手。有些疾病在传播过程中有一系列环节，如能打断其一个环节，就能达到控制和消灭病原的目的。
1．生态预防
鳝病预防宜以生态预防为主。生态预防措施有：
①保持良好的空间环境：养鳝场建造合理，满足黄鳝喜暗、喜静和喜温暖的生态习性要求。
②加强水质、水温管理：日常管理中做好环境的改善工作，为黄鳝创造良好的生活环境。由于鳝粪、残饵以及肥料渣等，在饲养过程中日积月累，使池水水质过肥，黄鳝容易生病。反之，过瘦也会导致黄鳝患病。因而，在饲养管理过程中，一定要认真观察水质变化，及时采取培肥、加水和换水等有效措施。
水温高于30℃，应采取加注新水、搭建遮阳棚、提高凤眼莲的覆盖面积或减小黄鳝密度等防暑措施；水温低于5℃时，应采取提高水位，搭建塑料棚或放干池水后也在泥土上铺盖稻草等防寒措施。
③在鳝池中种植挺水性植物或凤眼莲、喜旱莲子草等漂浮性植物，在池边种植一些攀援性植物。水草不仅能起到防暑御寒的作用，而且还可以为黄鳝提供隐蔽场所，有明显的净化改良水质的作用，可有效降低黄鳝的发病率。
④在池中搭配放养少量泥鳅以活跃水体。同时，每池放入数只蟾蜍，以其分泌物预防鳝病。
2．药物预防
药物预防措施有
①鳝种消毒：放养前鳝种应进行消毒，一般可选用以下消毒剂：食盐，浓度为2.5％～3％，浸浴5～8分钟；聚维酮碘（含有效碘1％），浓度为20～30毫克/升，浸浴10～20分钟；四烷基季铵盐络合碘（季铵盐含量50％），浓度为0.1～0.2毫克/升，浸浴30～60分钟。
②环境消毒：周边环境用漂白粉喷洒；土池和有土水泥池在放养前10～15天用生石灰150～200克/立方米消毒，再注入新水；无土水泥池在放养前15天用生石灰75～100克/立方米消毒，或用漂白粉（含有效氯28％）10～15克/立方米，全池泼洒消毒；网箱在放养前15天用20毫克/升高锰酸钾浸泡15～20分钟。
③定期消毒：饲养期间每10天用漂白粉（含有效氯28％）1～2毫克/升全池遍洒，或生石灰30～40毫克/升化浆全池遍洒，两者交替使用。
④饲料消毒：动物性饲料在投饲前应洗净后在沸水中放置3～5分钟，或用高锰酸钾20毫克/升浸泡15～20分钟，或5％食盐浸泡5～10分钟，再用淡水漂洗后投饲。
⑤食台、工具消毒：养鳝生产中所用的食台、工具应定期消毒，每周2～3次。用于消毒的药物有高锰酸钾100毫克/升，浸洗30分钟；5％食盐，浸洗30分钟；5％漂白粉，浸洗20分钟。发病池的用具应单独使用，或经严格消毒后再使用。
3．病鳝隔离
在养殖过程中，应加强巡池检查，一旦发现病鳝，应及时隔离饲养，并用药物处理，当连片鳝池的某一个池子发生传染病时，一定要做好“封池”隔离工作，即在该池用过的网具等，要经过消毒后，才能再在其他池中使用。死鳝要挖坑埋好，切勿乱丢，同时应避免该池水流入其他鳝池，以防传播蔓延。
药物处理方法按NY5071-2002《无公害食品渔用药物使用准则》的规定执行。
