猪细小病毒病的病原是猪细小病毒，属于细小病毒科(Parvoviridae)、细小病毒属(parvovirus)的自主型细小病毒，血清型单一，很少发生变异，目前所有分离株的血凝活性、抗原性、理化特性及复制装配特性等均十分相似或完全相同，而且猪细小病毒与同型的其他自主型细小病毒在结构与功能方面也存在许多相似之处。成熟的猪细小病毒完整病毒粒子外观呈六角形或圆形，具有典型的二十面立体对称结构，无囊膜，衣壳由32个壳粒组成，直径约为25～28nm。本病毒对外界理化因素有很强的抵抗力，对热具有强大抵抗力，56℃30min不影响其感染性和血凝活性，70℃2h仍不使其丧失感染性和血凝活性，但是80℃5min可使其丧失感染性和血凝活性;对脂溶剂(如乙醚、氯仿等)有抵抗力;对酸、甲醛蒸汽和紫外线均有一定抵抗力;但是在0.5%漂白粉或氢氧化钠溶液中5min被杀死。该病毒具有良好的血凝活性，能够凝集人的O型、豚鼠、大鼠、鸡、猫、猴的红细胞，但是不能凝集牛、绵羊、仓鼠、猪的红细胞，其中以凝集豚鼠红细胞为，在凝集鸡红细胞时存在个体差异。
本病毒一般只能在来源于猪的生长分裂旺盛的细胞(如原代猪肾、猪睾丸细胞和传代细胞PK-15，IBRS-2等)上增殖，其体外复制是杀细胞性的，细胞病变表现为细胞隆起、变圆、核固缩和溶解，后许多细胞碎片黏附在一起使受感染的细胞单层外形不整，呈“破布条状”。另外，不同毒株间存在培养温度依赖性差异，从而可以解释不同分离株在猪体内的复制能力和毒力差异的现象。
