猪伪狂犬病与猪乙脑病的鉴别诊断，对于出现神经症状的病例，临床诊断时应当把结合下述特点，进行鉴别诊断：
1、木乃伊胎儿：有木乃伊的考虑伪狂犬、蓝耳病和细小病毒病，而不考虑乙脑；
2、死胎、弱仔的头盖骨是否肥厚：肥厚的怀疑乙脑；
3、剖检死胎看前、后驱皮下水肿：后驱水肿的怀疑乙脑，前驱水肿的怀疑伪狂犬；
4、“过奶”“过料”的怀怀疑伪狂犬；
5、呕吐：母猪、育肥的中大猪有此症状怀疑伪狂犬；
6、剖检脑部病变：脑膜出血、水肿脑盖骨出血怀疑伪狂犬，脑组织出血、沟回间出血怀疑乙脑。
伪狂犬同圆环病毒的鉴别诊断 本病同圆环病毒的临床区别一是看吻突，吻突半圆的顶端红肿、或有绿色至豇豆大小紫黑色淤血斑点的怀疑伪狂犬病毒感染，颜色深暗、触诊发凉的怀疑圆环病毒感染；二是看四肢下部或躯体皮肤是否有疖痘样溃点，有疖痘样溃点的怀疑圆环病毒感染；三是触摸腹股沟淋巴结，肿大的怀疑圆环病毒；剖检腹股沟淋巴结颗粒肿但呈白色的怀疑圆环病毒感染，不肿大但是表面呈灰色、红黄色或浅红色的怀疑伪狂犬病毒感染。
剖检对于胃部淤血、出血、溃疡病例，应注意溃疡部位：贲门区溃疡的怀疑圆环病毒感染，幽门区溃疡的怀疑伪狂犬病毒感染；肾脏的病变也不同：感染伪狂犬病例肾脏表现为多少不等的针尖出血点，而感染圆环病毒的则为绿豆大小的边缘整齐的白色坏死灶。
