选种是果子狸养殖场的一项经常性工作，每年至少进行3 次选择，即初选、复选和精选。
1.初选
5一6月份对成年果子狸根据选择标准进行初选。当年幼狸在断乳时，根据同窝仔狸数、生长发育情况，出生早晚进行初选。要求选择出生早(雄仔狸在5月5日前，雌仔狸在5月10日前)、发育正常、谱系清楚、采食早而旺盛的仔狸。
在初选时，凡是符合选种条件的成年果子狸全部留种，仔狸应比计划数多留30%一50%。
2.复选
每年9-10月份进行。是根据脱毛、换毛、生长发育、体况恢复情况，在初选的基础上进行复选。成年种狸，初选的多数不变，只是淘汰少数有病或体质恢复较差的种狸。对育成果子狸(幼狸)，则要选择发育正常、毛绒品质好、体质健壮、体型适中和换毛早的个体留种。在复选中种狸数应高于计划留种数的20%一25%，为精选打好基础。
3.精选
在每年11月份屠宰取皮、肉类加工之前进行。对所有预选种狸进行全面鉴定，最后按计划精选定种狸群。
在精选数量上，应优先选留成年，不足部分用幼狸补充，当年幼狸的比例不赶过狸群的30%。最后保持种狸群公母比例为1:3或1:2。
引种应在11月份进行，引种过早果子狸应激反应强烈，适应环境能力差，抗病力低。弓}种太晚将对翌年的繁殖带来很大影响。
