甲鱼养殖必须坚持无病预防、有病早治、防重于治的原则，采取综合预防措施，减少疾病发生、确保和促进甲鱼健康生长。
1 选择优质甲鱼，把好苗种质量关
选择优质甲鱼苗种是预防甲鱼疾病的重要环节。选择苗种时，先要了解苗种的来源，引进苗种要经过严格检疫。刚孵出稚甲鱼以体形正常、体重4克以上、腹部呈桔红色者为佳，且颜色越红、个体越重体质越好，体重3克以上，腹部淡红色者体质较差。选择幼甲鱼或亲甲鱼要求外形完整，个体肥壮，裙边厚实，皮色光亮，无明显伤残，活动敏捷，仰放于地能迅速翻身逃跑。凡身体浮肿的注水甲鱼，颈部肿胀不能伸缩的病甲鱼和颈部有硬物钩钓甲鱼，以及外观弱瘦有明显炎症、病灶或病态的甲鱼均不选饲养。
2 控制病源，把好消毒灭菌关
土甲鱼池在放养前要清除淤泥，然后用150-300ppm的生石灰或用20ppm的漂白粉消毒灭菌，水泥池还可用50ppm的高锰酸钾等药物消毒，养殖工具也要用30ppm高锰酸钾溶液消毒杀灭病源。甲鱼在下池前要药浴消毒，防体表寄生虫可用2.5%的食盐水浸浴10-20分钟；防细菌性疾病可用20-30ppm呋喃唑酮药液浸浴20-30分钟；体表有外伤的甲鱼要涂沫消炎药膏，还要口服消炎药物。
3 创造良好环境，把好水质关
甲鱼池要建在水源方便、水质清洁不含毒物、阳光充足、环境安静的地方，池内设施要符合甲鱼的生态要求，池底铺垫软泥细沙，池中适当放养些水浮莲、水葫芦或浮萍等水生植物，既可净化池水、减少换水量，还能为甲鱼提供隐蔽场所，创造适宜的生活环境。
4 合理放养，把好密度关
甲鱼放养密度要适宜，规格必须整齐一致，不能大小同池混养，否则因相互斗咬而造成伤残并引发疾病。较为合理的放养密度为每平方米水池面积放养15克1只的稚甲鱼60只左右、50克1只的40只左右、100克1只的25只左右、150克1只以上的15只左右，亲甲鱼以每平方米放养1只为宜。
5 注重饲料质量，把好饲料关
饲料的质量不仅直接影响甲鱼的生长发育，也是导致甲鱼疾病的主要因素之一。投饲要坚持“五定一清”的原则，即：
5.1 定时 一般每天上午8-9时与下午5-6时各投饲1次，让甲鱼养成按时进食的习惯。
5.2 定位 设置固定食台，饲料投放食台上，便于甲鱼进食和清理残剩饲料。
5.3 定质 讲究饲料质量，不投变质饲料。动物饲料要新鲜，并切碎投喂；配合饲料要求营养成分全面，脂肪含量不宜太高，蛋白质含量在45%以上，且颗粒大小要适口。
5.4 定量 日投料根据甲鱼体重，水温高低，饲料种类和甲鱼进食灵活掌握，一般配合饲料日投量为甲鱼体重2%左右，鲜活动饲料5-10%，二小时吃完为宜。
5.5 定期喂药饵 一般每日投喂防病药饵1次，每次连投5-6天。为防耐药性，可采取多种药物交替内服法。
5.6 清渣 及时清除甲鱼吃剩的残渣剩料，食台勤刷，并且定期进行食台清毒。
5.7 加强管理 要坚持早、中、晚巡池检查，随时掌握甲鱼的进食与活动情况，发现患病的甲鱼要捕出进行检查诊断。有条件要用镜检和细菌培养等方法，以确定病源，并进行水质检测和饲料检测，找病因对症治疗，对病鱼要换新水、清毒。
