稚龟暂养期结束后进入工厂化养殖阶段。
这一阶段主要是通过工厂化自动控温的技术手段，将稚龟――幼龟放养在最佳环境中，加快生长速度，缩短养殖周期。稚龟分批出壳后逐渐进入冬季，在自然状态下，稚龟体质差的难以越冬，造成死亡多。在人工条件下，给以最佳温度和全价饲料，采取必要的生态调控措施，冬、春两季在温室中饲养，规格可达500g左右，夏季来临气温升高时将幼龟移出温室进入自然环境的露天池中饲养，几个月后即可长成1500g的商品龟上市。实践证明，稚龟阶段生长缓慢，当鳄龟达到250克以上生长速度加快，当规格达到500克时移到室外饲养阶段生长速度更快，平均每个月可增重200克，其生长速度十分惊人。也就是说，采用工厂化养殖，鳄龟从出生7g左右长成1500g仅需1年的时间，如采用自然温度养殖，不仅成活率低，要达到1500g的商品龟规格需要养殖时间3年。因此工厂化养殖鳄龟可缩短养殖周期2年。市场千变万化，早产出有利于抓住机遇，降低单位成本，提高竞争力。
工厂化养殖鳄龟的基本要点：
1）温室建造。采用节能型温室不仅投资省，保温性能提升后节约热能。屋顶使用两层薄膜中间夹保温材料的方法，四面墙体夹保温材料，特别注意的是室内地面必须安放保温材料，只有这样才能保证温室的保温节能效果，其实养龟温室的新建与造冷库的原理一样，要确保保温效果。
2）控温装置。小型温室或大型温室均可采用先进的专利技术，“龟鳖温室自动热水循环节能加温装置”，已经获得国家知识产权局颁发的专利证书，专利号为ZL01217344.4。该专利最大特点是：使用无烟煤全封闭运行对温室的空气和调节池水体进行自动加温，关键是热水自动循环，保证等温换水需要，每天耗煤量仅为每平方米500g，节能显著。
3）增氧设备。温室中呈现高温、高密度、高污染特征，增氧有助于改善水质，帮助有机物分解，减少污染。一般每500平方米温室配套2.2千瓦的增氧机。
4）进排水系统及池底需一定倾斜，与室外龟池建造的要求相同。排水口用直径10cm的PVC管插入止水，抽出排水，简易可行。
5）食台设置。用石棉瓦斜放入龟池中，水下1/3，水上2/3，投喂饲料开始在食台的水下，逐步移到水上投喂，有利于观察摄食情况并减少残饵。
6）消毒防病。定期用生石灰浆化水稀释后全池泼洒，并可采用先进的臭氧发生器定时自动对养龟水体进行消毒，效果好，成本低。
7）饲料配置。最好自己做饲料，买一套小型的饲料生产机组，使用先进的饲料配方，鳄龟饲料基本成分为白鱼粉、α-淀粉、植物蛋白、矿物质、维生素、益生菌、益生元，并可添加其它绿色饲料添加剂，以促进的鳄龟的生长，减少营养性疾病发生，提高养殖成活率。
8）饲养管理。对小鳄龟养成阶段投喂配合饲料，如果是粉状饲料需加水、玉米油、鱼油做成软颗粒或团状，放在食台上。如果养殖的品种是大鳄龟，投喂漂浮在水面的膨化饲料，形成动态的饵料能引诱不爱动的大鳄龟吞食。每天投喂2次，每次投喂量以2小时内基本吃光，仅剩少许为宜。发现水质变化，氨浓度较高，就要及时换水，有条件的养龟场可采用经典的水化学分析方法或现代仪器自动检测水质，并可采用电脑监控的方法对温室内鳄龟活动情况进行跟踪观察，发现问题立即采取措施。现代技术已经做到自动测试、自动换水、自动分析、自动报警。在饲养过程中要特别提醒的是“等温换水”。在稚龟从室外移到室内要逐渐升温，当幼龟移到室外要逐渐降温，注意温度的平衡。在养殖全程始终记住12个字：“环境调控、结构调控、生物调控”，并细细品味。
