在养殖过程中，肉鸡呼吸道病一般发病较早，有的甚至3～5日龄时就出现呼吸道症状。临床表现为轻微甩鼻、咳嗽，在接种病苗后，症状加重。有的发病是免疫活疫苗后48出现呼吸道症状，主要是因为活毒疫苗对鼻腔、喉头、气管黏膜、肺、气囊会造成很大的损伤，致使肉鸡产生了一系列的呼吸道病症状。
尤其是7日龄左右的首免，一般用的都是两种活毒疫苗，较为严重。特别是新支二联、法氏囊这两种疫苗，对呼吸道黏膜的破坏尤为严重，再者，由于免疫后的应激反应，肉鸡机体抵抗力下降，所以临床上呼吸道症状表现尤为突出。因此大多数的养殖户心理上开始惧怕疫苗接种，有的把加强免疫的时间不断推迟，部分养殖户甚至放弃，转而采用抗生素类药物配合抗病毒药物进行治疗和预防。
结果导致个别鸡群在第3周龄免疫新城疫疫苗后，出现大量死亡，而且暴发包心包肝症状的大肠杆菌病。4～5周龄后，鸡群呼吸道症状加重，排黄白色或黄绿色稀便，死亡率升高，这时再用药物是不会产生的效果的。
