消毒可以说是肉鸽养殖场的一项重要工作，也是养鸽户做好鸽病防控策略的重要一环，养鸽场可根据不用的消毒对象，选择不同的消毒方法，从而达到预期的消毒效果，避免细菌滋生，减少致病微生物对鸽群的侵害。肉鸽养殖场比较常见的消毒方式可分为物理消毒和化学消毒两种，具体的方法可参考以下几点。
1.及时清扫、冲洗
及时清扫鸽舍内外、冲洗地面是最常见的物理消毒方法，这种方式比较适合鸽舍、养鸽设备及运输工具的消毒，也是比较基本和比较经济的消毒方法，以鸽舍为例：及时、彻底的清扫和冲洗粪便、灰尘、羽毛等废弃物，能有效去除鸽舍中大多数的有害细菌，为种鸽生活、生产创造有利健康的大环境。
2.煮沸、紫外线等消毒
通常养鸽户还会使用煮沸、紫外线消毒等常见物理消毒法对工作服、垫布、器皿等肉鸽相关用具消毒，需要特别注意的是所要煮沸的物品一定要完全浸泡入水，水沸腾的状态一定要持续30分钟左右的时间，煮沸后的物品需要放置在干净清洁的地方，防止二次污染，且煮沸消毒后的物品要求现煮现用，放置的时间不宜太久。
3. 浸泡、喷雾
化学消毒最常见的方法是通过添加化学制剂使用浸泡、喷雾等方法对养殖场进行消毒的工作。在养殖场的门口可设立消毒池，使用石灰乳、漂白粉或是氢氧化钠等按照一定的有效浓度消毒，并定期更换消毒剂。喷雾消毒则是使用消毒剂配制成一定浓度的消毒液，对养殖场空气、墙壁、地面、笼具等进行定期或不定期的消毒。
