在蚯蚓养殖过程中，蚯蚓饲料（家禽粪便、酒糟、蔗渣、剩余饭菜、废血和动物内脏等）的发酵处理是个关键，如饲料没有发酵或发酵不彻底，将产生有害气体，酸碱度过高或过低，都可能使蚯蚓逃逸、不产茧甚至死亡。利用EM原液对粪料进行发酵处理，粪料发酵时间大大缩短，异味降低，而且饲料发酵好以后，PH值自然会达到6.5～7.5，不必调节，直接就可以饲喂，饲料利用率大大提高，蚯蚓产茧多，繁殖快，产量提高2～3倍。方法如下：
EM菌：EM菌发酵鸡粪做饲料的原理和方法
一、架堆
用稻草、秸秆（裁成小段更好）先铺一层（厚10～15厘米）干料，然后在干料上铺粪料（4～6厘米厚），如此重复铺3～5层，每铺一层用喷水壶喷水（EM原液就在此时加入粪堆中，一吨粪料需要EM10公斤兑水100公斤左右），直至水渗出为好；如采用垃圾，一层垃圾一层粪，长宽不限，并用薄膜盖严；如果用100%粪料，先把粪料晒至五六成干后架堆，用EM兑水淋湿，用薄膜盖严。
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二、翻堆
在气温较高的季节，一般第2天堆内温度就会明显上升，4～5天可升至60℃～70℃，以后逐渐下降，当堆内温度降至40℃时（这个过程需12天）则进行翻堆，把上面翻到下面，两边翻到中间，并再加入EM稀释液。冬天翻堆2～3次，夏天翻堆1次。
三、投喂
饲料发酵结束后，扒开饲料淋水散热后即可使用，投喂时一般采用上添法和侧喂法，上添法就是把饲料铺盖在原有已被蚯蚓吃过的饲料上，每10～15天进行1次；侧喂法就是取出部分已吃完的饲料再把新饲料添在一边，下次添加另一边。
