鱼类改变水族箱中的水质
加入水中的人工饲料，对鱼类和水质都也绝大的影响。鱼类会消耗氧气并释放排泄大量的化学物质，如:尿酸，氮化合物，等。水中的细菌会分解这些物质的大部分，并转化为矿物质。当然，在分解的过程中会消耗大量的氧气。慢慢的，水中的硝酸盐和磷酸盐含量就升高，而碳酸盐硬度及酸碱值（PH值）就会下降。
水草改变水族箱的水质
蔓生的绿色植物，尤其是茎状植物在白天会消耗二氧化碳，而全天都会氧气和有机矿物质。光合作用白天会释放氧气并吸收二氧化碳而导致水中PH值升高，叶面上出现碳酸钙的沉淀。水中饵料过多的话，有时会导致植物生长的停滞，待植物死亡后，其中储藏的养分如淀粉等会释放与水中，致使水中养分增高，氧气含量则锐减。
何谓水族箱中的生态平衡
很多人深信，只要在水族箱里放养一定的鱼和植物，水族箱内的生态便可永保平衡稳定。其实并非如此，如果照那种方法来做的话，水族箱里的生态绝对是一种倾斜。
第一种可能是:鱼类占据了整个水族生态的优势。他们借着充分的养料（如:硝酸盐和磷酸盐）而大量繁殖，所排泄的过多的废物和毒素却阻碍了植物的生长。浑浊了水质更促成了蓝藻，菌类及鞭毛藻类的过度繁殖，最后，这些藻菌压倒植物而和鱼类称霸整个水族箱。
第二种可能是:植物占了优势。它们消耗掉大部分的二氧化碳，造成碳酸化合物增加，而鱼类及细菌的养分都大量减少，最后整个水族箱的生态都被迫停止生长。
为什么一开始妥善的按排，竟会演变成另人意象不到的结果呢？那是因为我们根本就不该奢望能一劳永逸的保持水中的生态平衡。
如果水中的生态失衡，用肉眼是很容易辨识的，问题是那是以回天乏术了，所以，一有失衡的倾向时，就应该密切注意。若要测试水中的优势是鱼类、藻菌或植物，可用滴定检验法。当水中磷酸盐含量高于0.1PPM且硝酸盐含量大于30PPM时，表示鱼类占了优势:反之则表示植物占了优势。
水中缺氧时，最明显的现象是早上发现鱼缸里漂浮着死鱼，或是鱼儿在水面痛苦的挣扎呼吸。水中若是缺乏二氧化碳，则会在植物叶面或底部发现白色的碳酸钙沉淀，同时水的PH值也会升高。
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